Su Eminencia el IX Drukpa Choegon Chokyi Senge fue reconocido a la edad de cuatro años por Su Santidad el XVI Gyalwa Karmapa, cabeza espiritual del Linaje Karma Kagyu. El Karmapa presentó S.E. el VIII Khamtrul Rimpoché con tres cartas detallando la ubicación precisa de Drukpa Choegon, la casa, los apellidos de su familia y el año de su nacimiento. S.E. Khamtrul Rimpoché entonces junto con muchos yoguis visitaron a los papás yóguicos de Rimpoché en la remota región de los Himalaya de Kinnaur.

Rimpoché fue entronizado a la edad de seis años en el monasterio de Khampagar, India. Entonces inició su educación formal y entrenamiento, el cual incluía lectura, escritura, caligrafía, rituales, mandalas de arena, visualizaciones y meditación. A los catorce años de edad, Rimpoché fue invitado a Bután por S. E. Khamtrul Rimpoché. S. E. Khamtrul Rimpoché le transmitió las enseñanzas completas de la tradición Drukpa. Poco después S. E. Khamtrul Rimpoché falleció a la edad de cuarenta y cinco años. Su Santidad Dilgo Khyentse todavía estaba en Bután en ese momento y tomó el manto de maestro hasta su muerte en 1995.

Los maestro principal de Rimpoché durante esta vida han sido S.E. el VIII Khamtrul Rimpoché, S.S. Dilgo Khyentse Rimpoché, S.E. Trulshik Adeu Rimpoché, S.S. Je Khenpo de Bután y Tulku Orgyen Rimpoché. Por consejo de S.S. Dilgo Khyentse Rimpoché, Rimpoché completó muchas prácticas en retiro, incluyendo Vajrakilaya, Tara Verde, Buda Amitayus, Vajrapani, Kurukulle, Padmasambhava, etc.

Cuando tenía diecinueve años, Rimpoché inició sus estudios en filosofía que duraron nueve años y a la edad de veintiocho recibió el grado de Khenpo (equivalente a un doctorado en filosofía). S.E. Drukpa Choegon Rimpoché Chokyi Senge fue elegido entonces como director espiritual de la comunidad de 600 tibetanos en Tashi Jong y las comunidades circundantes. Durante ese tiempo construyó una escuela nueva para los lamas, renovó los templos, proveyó de apoyo financiero para las grandes pujas anuales, ayudó a asegurar la fuente de agua limpia para la comunidad, mejoró la educación de los monjes, mejoró los salarios de los empleados laicos, inspiró a los jóvenes a trabajar para la comunidad.

También ayudó a los ancianos y a los necesitados, inició un programa de patrocinio y proveyó los fondos para ayudar a mejorar el estado de la clínica médica. Actualmente Rimpoché está involucrado con proyectos que incluyen construir un nuevo monasterio en Kullu y el establecimiento de un convento en Kinnaur, su lugar de nacimiento. Además, Rimpoché proporciona loa fondos para la renovación y preservación de muchos templos viejos a través de las regiones occidentales de los Himalaya.